Рис.1
Первую попытку систематизации животных в IV веке до н. э. предпринял греческий учёный Аристотель — в своих сочинениях «О частях животных» и «О возникновении животных» он выделил всех известных ему птиц в «высший» род Орнитес. Несмотря на очевидное несовершенство этой системы, вплоть до второй половины XVII века новых попыток классификации животного мира не предпринималось. В 1676 году вышла в свет рукопись «Орнитология», написанная английским биологом Френсисом Виллоуби и уже после его смерти оформленная и опубликованная его другом и учёным Джоном Реем. Это первая работа, в которой авторы попытались классифицировать птиц на основании внешних, морфологических признаков. Позднее, в 1758 году шведский натуралист Карл Линней активно использовал этот труд при создании своей Системы природы, в которой ввёл иерархические категории и биноминальную номенклатуру при обозначении видов, которые и используется вплоть до настоящего времени.
В системе Линнея все животные были разбиты на шесть основных категорий — классов, одну из которых, наряду с млекопитающими, амфибиями, рыбами, червями и насекомыми, заняли птицы. Альтернативная филогенетическая систематика рассматривает группу «Птицы» в качестве клады тероподных динозавров. Согласно теории происхождения птиц от древних ящеров, «Птицы» и её сестринская клада «Крокодилы» считаются единственными современными ветвями клады рептилий «Архозавров». Все современные птицы имеют единого предка, которым некоторые ученые считают Археоптерикса (рис.1). Другие ученые полагают, что археоптерикс не был предком современных птиц. Ряд известных динозаврологов и последователей системы ФилоКод, таких как Жак Готье, Луис Киаппи и их последователей, под категорией «Птицы» понимают лишь современных птиц, не включая туда группы, известные лишь по ископаемым останкам — археоптерикса, энанциорниса, конфуциусорниса, патагоптерикса и некоторых других. Однако эти учёные ввели новую категорию «Птицеобразные», или птиц в широком смысле, которая объединяет живущие в наше время виды и их ископаемых предшественников.
Все современные группы птиц относятся к инфраклассу, или веерохвостых птиц, который в свою очередь разделяется на две категории — «бескилевые птицы» (сюда входят, как правило, нелетающие птицы вроде страуса), и «новонёбные птицы» (включающий все остальные виды). Обычно эти две категории имеют ранг надотряда, хотя в работах Лайвези и Зуси рассматриваются как когорты. В зависимости от системы классификации насчитывают от 9800 до 10 050 современных видов птиц.